Gene Regulatory Networks: Methods and Protocols

شبکه های تنظیم کننده ژن با کنترل بیان ژن نقش حیاتی در رشد و عملکرد ارگانیسم ایفا می کنند. با در دسترس بودن توالی ژنوم کامل، چندین رویکرد آزمایشی و محاسباتی جدید به تازگی توسعه یافته اند که به طور قابل توجهی توانایی ما را برای توصیف جامع این شبکه های نظارتی با فعال کردن شناسایی اجزای وضعیت ژنومی یا تنظیمی آنها، یا تعامل بین این دو، افزایش می دهد. با جزئیات بی سابقه شبکه‌های تنظیم‌کننده ژن: روش‌ها و پروتکل‌ها که به پنج بخش مناسب تقسیم می‌شود، توضیح می‌دهد که چگونه هر یک از این رویکردها به درک کامل‌تری از ترکیب و عملکرد شبکه‌های تنظیم‌کننده ژن کمک می‌کنند، در حالی که یک پروتکل جامع در مورد چگونگی آنها را در آزمایشگاه اجرا کنید. این فصل‌ها با فرمت بسیار موفق روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی™ نوشته شده‌اند، شامل مقدمه‌ای درباره موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های آزمایشگاهی گام به گام و به آسانی قابل تکرار، و یادداشت‌هایی در مورد عیب‌یابی و اجتناب از دام‌های شناخته شده.

معتبر و در دسترس، شبکه‌های تنظیم‌کننده ژن: روش‌ها و پروتکل‌ها با هدف ارائه اطلاعات جامع و کامل به محققان تازه‌کار و با تجربه جعبه ابزار به موقع برای مطالعه شبکه های تنظیم کننده ژن از نقطه تولید داده تا پردازش، تجسم و مدل سازی.

Gene regulatory networks play a vital role in organismal development and function by controlling gene expression. With the availability of complete genome sequences, several novel experimental and computational approaches have recently been developed which promise to significantly enhance our ability to comprehensively characterize these regulatory networks by enabling the identification of respectively their genomic or regulatory state components, or the interactions between these two in unprecedented detail. Divided into five convenient sections, Gene Regulatory Networks: Methods and Protocols details how each of these approaches contributes to a more thorough understanding of the composition and function of gene regulatory networks, while providing a comprehensive protocol on how to implement them in the laboratory. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology™ series format, chapters contain introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and notes on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Authoritative and accessible, Gene Regulatory Networks: Methods and Protocols aims to provide novices and experienced researchers alike with a comprehensive and timely toolkit to study gene regulatory networks from the point of data generation to processing, visualization, and modeling.