Frontiers in Computational and Systems Biology

مطالعات زیست‌شناسی و زیست‌پزشکی به دلیل استفاده گسترده از مدل‌های ریاضی و رویکردهای محاسباتی وارد عصر جدیدی شده‌اند. چیزی که 20 سال پیش بیش از فانتزی یک نظریه پرداز نبود، به حوزه شکوفایی زیست شناسی محاسباتی تبدیل شد. علاوه بر این، این الگوی تحقیقاتی قدرتمند و محرک در مطالعات بیولوژیکی به نوبه خود به پیشرفت‌های جدیدی در ریاضیات، فیزیک و علوم رایانه منجر شده است.

این جلد منحصر به فرد به بررسی پیشرفته‌ترین تحقیقات در مورد روش‌های آماری در مولکولی می‌پردازد. و زیست شناسی سیستم ها، با مشارکت کارشناسان برجسته در این زمینه. هر فصل جنبه های نظری، کاربردهای مشکلات بیولوژیکی و پیشرفت های احتمالی آینده را مورد بحث قرار می دهد. درک زیست شناسی در سطح مولکولی و سیستمی یکی از هیجان انگیزترین چالش های پیش روی علم مدرن است. این متن به وضوح نشان می‌دهد که چگونه روش‌های محاسباتی و ریاضی برای رسیدگی به این چالش ادامه می‌دهند.

موضوعات و ویژگی‌ها:

• استفاده از مدل‌های ترمودینامیکی را ارائه می‌کند. تجزیه و تحلیل مکانیسم های تنظیم کننده ژن
• الگوریتم های اصلی را برای پیش بینی ساختار ثانویه RNA، با تمرکز بر رویکردهای مبتنی بر مجموعه بررسی می کند
• بحث می کند که چگونه پیشرفت ها در زمینه آرایه های الیگو منجر به درک بهتر شده است. مکانیسم آرایه و بهبود در تجزیه و تحلیل داده های ریزآرایه
• کاربرد مدل های فرآیندهای تصادفی را در ترمودینامیک غیرتعادلی و انتقال سیگنال بیولوژیکی بررسی می کند
• روش های ردپای فیلوژنتیکی را برای شناسایی TFBS، بر اساس ترازها توصیف می کند.
• روش‌های مبتنی بر رگرسیون جریمه‌شده را برای ایجاد تعامل ژنتیکی یا شبکه‌های تنظیمی معرفی می‌کند
• نقش خاصی را که فرآیندهای مارکوف برگشت‌ناپذیر در مدل‌سازی سیستم‌های بیوشیمیایی سلولی بازی می‌کنند، بررسی می‌کند. مفهوم ماژول های ژن در یک شبکه تنظیمی رونویسی

با بررسی موضوعات داغ فعلی در زیست شناسی محاسباتی و زیست شناسی سیستم ها، ارائه شده توسط منتخبی بین المللی از محققان برتر، این متن ضروری برای محققان و محققین است. دانشجویان تحصیلات تکمیلی در زیست شناسی محاسباتی، زیست شناسی و ریاضیات.

Biological and biomedical studies have entered a new era due to the widespread use of mathematical models and computational approaches. What was no more than a theoretician's fantasy 20 years ago has become the blooming field of computational biology. Furthermore, this powerful and stimulating research paradigm in biological studies has in turn led to new developments in mathematics, physics and computer science.

This unique volume surveys state-of-the-art research on statistical methods in molecular and systems biology, with contributions from leading experts in the field. Each chapter discusses theoretical aspects, applications to biological problems, and possible future developments. Understanding the biology at a molecular and system level stands among the most exciting challenges faced by modern science. This text clearly demonstrates how computational and mathematical approaches continue to address this challenge.

Topics and features:

• Presents the use of thermodynamic models to analyze gene regulatory mechanisms
• Reviews major algorithms for RNA secondary structure prediction, with a focus on ensemble-based approaches
• Discusses how developments in the area of oligo arrays has led to a better understanding of the array mechanism and improvements in microarray data analysis
• Examines the application of models of stochastic processes in nonequilibrium thermodynamics and biological signal transduction
• Describes phylogenetic footprinting methods for TFBS identification, based on alignments
• Introduces penalized regression-based methods for constructing genetic interaction or regulatory networks
• Investigates the specific role played by irreversible Markov processes in modeling cellular biochemical systems
• Explores the concept of gene modules in a transcriptional regulatory network

With reviews of current hot topics in computational biology and systems biology, supplied by an international selection of top researchers, this is an essential text for researchers and graduate students in computational biology, biology and mathematics.